Государственный сектор должен объединить научно-исследовательские организации, которые могли бы стать основным исполнителем и координатором фундаментальных и поисковых исследований, а также НИОКР в рамках федеральных целевых программ, крупных межрегиональных и межгосударственных проектов.
Ограниченность бюджетных средств требует повышения эффективности научных исследований и привлечения средств из новых источников. Целесообразно рассмотреть возможность объединения в межотраслевые центры государственных научных организаций, занимающихся схожими исследованиями, требующими дорогостоящей экспериментальной и испытательной базы. Следует возложить на них ответственность за проведение работ по важнейшим направлениям исследований и практическое использование полученных результатов.
Формирование интеграционных научно-образовательных комплексов должно стать одним из важных направлений реализации взаимосвязей между наукой и высшим образованием.
Эффективным инструментом по осуществлению скоординированной научно-технической политики по отношению к государственному и негосударственному секторам научно-технического комплекса призвана стать государственная аккредитация, предоставляющая организации независимо от формы собственности установленные законодательством льготы и проводимая на добровольной основе.
Реструктуризация сети научных организаций будет основываться на анализе и оценке их деятельности федеральными органами исполнительной власти, принимающими решение о сохранении и месте научной организации в государственном секторе.
Реструктуризация государственного сектора науки может осуществляться путем передачи части организаций из федеральной в собственность субъектов РФ. В последнем случае представляется перспективным объединение научных организаций с финансово-промышленными группами.