В таблице 2.5 приведены примеры данных надзора, касающихся распространенности отдельных возбудителей болезни в поголовье скота в Европе. В методах сбора данных в разных выборках наблюдались различия, однако результаты показывают, как можно увидеть очаги инфекции в самом начале пищевой цепи.
Сельскохозяйственные животные становятся носителями микробиологических опасных факторов в результате горизонтальной передачи из окружающей их среды. Основными источниками являются другие инфицированные животные, корма, вода и дикая фауна, например, птицы и грызуны. Передачу между животными может усугублять интенсивное животноводство, при котором увеличиваются контакты между животными и затрудняется поддержание должной гигиены.
Исследования птицеферм в Европе и Соединенных Штатах Америки показывают, что зараженный Campylobacter птичий помет может распространяться по огороженным пространствам в виде пыли и может задерживаться на стенах, поилках, кормушках, на воде и кормах (30). Аналогичным образом, отбор проб пыли может быть точным средством определения присутствия Salmonella в стаде птицы и на оборудовании для транспортировки и упаковки яиц (31).
Традиционно важным источником сальмонеллы являются корма промышленного производства. В настоящее время большинство кормов подвергаются термообработке, поэтому уровень заражения в продуктах, получаемых с современных хорошо организованных комбикормовых предприятий, очень низок. Данные от управления ветеринарных лабораторий Соединенного Королевства за 1999 год (32) показали, что только в 0,7% проб экструдированных комбикормов для птицы и 1,5% проб кормовой муки для свиней и птицы была положительная реакция на сальмонеллу. Тем не менее, даже низкие уровни заражения могут быть значительными для только что выведенных цыплят, которые очень восприимчивы к колонизации.